科学技术部在国家科技发展和创新体系中扮演着核心角色，它的职能涉及政策制定、资金管理、科研项目评审以及国际合作等多个方面。在这些工作中，科研资金分配是一个至关重要的问题，因为它直接影响到科技研究的质量和效率。那么，什么因素会影响科研资金分配中的科学性和公平性呢？

首先，我们需要明确的是，科研资金分配是基于一定原则进行的，这些原则包括但不限于项目的科学性、社会需求、预期成果以及申请者的资质等。然而，在实际操作中，由于各种原因，这些原则可能会受到不同程度的冲击。

其一，是资源有限的问题。在现实世界中，政府对于科技投入总是有限制度严格，因为这涉及到大量财政开支。此时，即使是最有前景的项目也难免要面临竞争，如果没有合理的手段来筛选优劣，那么优秀项目很可能因为缺乏足够资源而无法得到必要支持。

其二，是利益关系的问题。当一个项目获得了较大的基金支持时，不少人都会对此产生兴趣，他们可能通过不同的方式寻求参与其中，从而影响到原本应该纯粹依据科学标准进行选择的事务。这包括但不限于政治背景、个人关系网或者商业利益等因素，都有可能干扰科研资金分配过程，使得真正有价值的事情无法得到应有的重视。

再者，有时候，由于信息获取不均衡或者评审流程存在问题，一些潜力巨大的新兴领域或学术团队由于缺乏相应的人脉或者经验，就难以获得足够多额外帮助，从而导致他们在竞争中落后。而这种情况往往与那些已经建立起强大基础设施和人脉网络的大型机构形成鲜明对比，这无疑削弱了公平性的体现。

为了解决这些问题，我们可以从以下几个方面出发进行改进：

提高透明度：将整个科研基金申请和评审过程公开化，让公众能够了解每一步决策背后的依据，同时也让所有申请者都能看到自己的位置，并根据这个信息调整策略。

建立健全评价体系：采用更加客观、专业化的评价标准，以减少主观判断带来的偏差，同时为那些具有潜力的新兴领域提供更多机会，使之能够更好地融入主流研究环境。

加强监督机制：设立独立第三方机构，对整个基金管理过程进行监控，以防止非法或不正当行为出现，同时还能保证那些遵循规章制度并且取得显著成果的小规模团队不会被忽视。

鼓励创新文化：培养一种开放的心态，让人才能够自由流动，不受地域限制，也不是简单地看重是否拥有某种特定的背景，而是在乎的是个人的能力和贡献，以及他所代表的小组或组织是否具备推动科技进步的潜力。

增强国际合作：通过与其他国家甚至地区之间的交流与合作，可以拓宽视野，更好地理解不同文化下的科学发展模式，为国内外各类研究人员提供更多学习机会，从而提升整体水平同时也是实现更公平分布的一种手段之一。

综上所述，虽然目前我们面临诸多挑战，但只要我们持续努力，不断探索新的方法，并且坚持为普适性的目标奋斗，无疑会逐渐构建出一个更加完善、高效又公正的地方级别甚至全球范围内的一个完整系统。这样做才能确保我们的科研投资回报丰厚，最终促进人类社会整体福祉的大幅提升。